David Aciole Barbosa

Doctor in Biotechnology, with emphasis on Bioinformatics. He has experience in Omic Sciences, focusing on the development, implementation and application of programs and computational infrastructure for the analysis of biological data. During his PhD, he dedicated himself to the study of microbiomes, using data from next-generation sequencing, as well as the development of LEfSemakeR application, a program in R language, available on the web-Shiny platform, for differential analysis between microbiota. During his master's, he used agnostic virtualization systems based on Docker containers to develop the ParaDB relational database (available at http://Paracoccidioides.com), an "open source" resource dedicated to providing comparative genomic information between pathogenic fungi of the genus Paracoccidioides. He also has experience with ​​Bash, Python, R and Perl programming languages, among others, as well as with high-performance computing environments based on Slurm Workload Manager systems. He is currently a collaborating researcher at the Center for Natural and Human Sciences at the Federal University of ABC and at the Integrated Center for Biotechnology at the University of Mogi das Cruzes.

Doutor em Biotecnologia, com ênfase em Bioinformática. Possui experiência em Ciências Ômicas, com foco no desenvolvimento, implementação e aplicação de programas e infraestrutura computacional para análises de dados biológicos. Durante o Doutorado, dedicou-se ao estudo de microbiomas, utilizando dados provenientes de sequenciamento de nova geração, bem como ao desenvolvimento do aplicativo LEfSemakeR, um programa em linguagem R, disponível em plataforma web-Shiny, para análises diferenciais entre microbiotas. Durante o mestrado, utilizou sistemas de virtualização agnósticos baseados em contêineres Docker para desenvolver o banco de dados relacional ParaDB (disponível em http://Paracoccidioides.com), um recurso "open source" dedicado a fornecer informações genômicas comparativas entre fungos patogênicos do gênero Paracoccidioides. Possui ainda experiência com linguagens de programação Bash, Python, R e Perl, entre outras, bem como com ambientes de computação de alto desempenho baseados em sistemas Slurm Workload Manager. Atualmente, é pesquisador colaborador do Centro de Ciências Naturais e Humanas da Universidade Federal do ABC e do Núcleo Integrado de Biotecnologia da Universidade de Mogi das Cruzes.