Joaquim Martins Junior

I have a Bachelor's Degree in Biological Sciences (2003) from the Federal University of Uberlândia, I have a Master's Degree in Biological Sciences (Cellular and Molecular Biology) (2006) and a Ph.D. in Biological Sciences (Cellular and Molecular Biology). During this period I was a scholarship professor of the Disciplines of Molecular Ecology associated to the Department of Ecology of UNESP and the discipline of Molecular Systematics next to the botany department. I worked as a Graduation Professor at the United Metropolitan University (FMU), where I taught classes for Biological Sciences and Biomedicine courses. I worked as a associated Post Doc researcher at the Institute of Chemistry of the University of São Paulo since 2011, where I developed research in the field of Bioinformatics, Genomics, Transcritomics, Phylogenomics and Evolution of microorganisms, mostly animal or plant pathogens. I have experience in the development of pipelines and workflows for assembly of genomes, RNAseq and phylogenetic analysis, besides working with command line tools in linux environment such as Perl, Python , R, Bash and integration of these with MySQL database. Recently, I joined the Integrative Omics research group at Brazilian Biorenewables National Laboratory / CNPEM.

Sou Bacharel e Licenciado em Ciências Biológicas (2003) pela Universidade Federal de Uberlândia, possuo Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Celular e Molecular)(2006) e Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Celular e Molecular)(2011), ambos pela UNESP - Rio Claro.Durante este período fui professor bolsista das Disciplinas de Ecologia Molecular junto ao Departamento de Ecologia da UNESP e da disciplina de Sistemática Molecular junto ao departamento de botânica. Atuei como Professor de graduação nas Faculdades Metropolitanas Unidas (FMU), onde ministrei aulas para os cursos de Ciências Biológicas e Biomedicina. Atuei como Pós Doutorando no Instituto de Química da Universidade de São Paulo desde 2011, onde desenvolvi pesquisa na área de Bioinformática, Genômica, Transcritomica, Filogenômica e Evolução de microrganismos, em sua maioria patógenos animais ou de plantas. Tenho experiência no desenvolvimento de pipelines e workflows para montagem de genomas, RNAseq e análises filogenômicas, além de trabalhar com ferramentas em linha de comando em ambiente linux como as linguagens Perl, Python, R, Bash e integração destas com banco de dados MySQL. Atualmente sou Analista de Desenvolvimento Tecnológico no grupo de Ômicas Integrativas do Laboratório Nacional de Biorrenováveis - LNBR/CNPEM.