Hello, welcome to my CV Lattes! I?m from Montes Claros, in northern Minas Gerais. My academic and professional qualifications are: (A) B.Sc. in Physics - UFMG (1987); (B) Specialization in Modern Biotechnology - Biotechnology Center of UFRGS (1988); (C) M.Sc. in Computer Modelling and Simulation of Molecular & Biological Processes - University of London (1990); (D) Ph.D. in Computational Molecular Biophysics - University of London (1994). From 1995 to 1998 I worked at the Environmental Molecular Sciences Laboratory at PNNL, US Department of Energy, and from 1999 to 2001 at the National Synchrotron Light Source Laboratory in Campinas, SP, Brazil. In this period, I was an FAPESP Young Researcher. In March 2001, I joined the Faculty of Informatics (FACIN) of the Pontifical Catholic University of Rio Grande do Sul (PUCRS) as an FAPERGS Visiting Researcher. Since June 2002, I am an associate professor at PUCRS, to where I brought the Laboratory for Bioinformatics, Modelling & Simulation of Biosystems (LABIO), a regional, national and international reference in the areas of structural bioinformatics and computational molecular biophysics. At CNPq, I lead the Group of Computational Molecular Biophysics (GBMC). Our research focuses on the relationship between sequence, structure, dynamics and function of biological macromolecules, such as proteins, nucleic acids, and their complexes. We develop and apply computational methods to investigate these relationships. Our research interests are in, but not limited to, the following topics: structure and dynamics of nucleic acids, structure and dynamics of proteins, prediction of three-dimensional (3-D) structure of proteins, simulation of receptor-ligand interactions, molecular docking, molecular dynamics simulations, comparative homology modeling, computer-aided drug design, and molecular docking of Fully Flexible Receptors (FFR) Model-ligands. I was a member and supported the activities of the Graduate program Biomedical Gerontology of the IGG PUCRS and Education in Science and Mathematics (EDUCEM). I am a permanent member of the following Graduate Programs: Computer Science (PPGCC at FACIN), Molecular & Cellular Biology (PPGBCM at FaBio) and Professional Master in Pharmaceutical Biotechnology (PPGMPBF at FFARM) of PUCRS. I was elected board member of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology AB3C (2007-2008) and have been a member of the Special Commission of Computational Biology (CEBioComp) of the Brazilian Computer Society (SBC) since 2009. On August 12, 2011, I was elected coordinator of the SBC CEBioComp for the period 2011-2012. I'm an "ad hoc" consultant for CNPq, CAPES, FAPERGS, FAPESP, FACEPE, FUNDECT, FIOCRUZ, LNCC, FOUNDATION ARAUCÁRIA, former associate editor of ISRN Bioinformatics and BMC Genomics, associate ediutor of Frontiers in Molecular Biosciences, reviewer for many journals and conferences, national and international. I coordinated and participated in the translation of the primary textbook of bioinformatics available in the Portuguese language. I formed and contributed to the formation of more than 20 M.Sc., dozens of Ph.D., and undergraduate students, with expertise originating from diverse fields, such computer science, computer engineering, information systems, physics, chemistry, biology, medicine, dentistry, biomedicine, pharmacy, and education. I published more than 50 scientific articles in leading journals and conferences. I edited a book in English and organized technical meetings. I have several technological productions and two patents. For contact, write me an e-mail: labio.osmarnds@gmail.com. Thanks for your interest.
Olá, sejam bem vindos ao meu CV Lattes! Sou de Montes Claros, no norte de Minas Gerais. Minhas qualificações acadêmicas e profissionais são: (a) Graduação em Física - UFMG (1987); (b) Especialização em Biotecnologia Moderna - Centro de Biotecnologia da UFRGS (1988); (c) M.Sc. em Modelagem e Simulação Computacionais de Processos Biológicos e Moleculares - University of London (1990); (d) Ph.D. em Biofísica Molecular Computacional - University of London (1994). De 1995 a 1998 trabalhei no Environmental Molecular Sciences Laboratory do PNNL, Departamento de Energia dos EUA e, de 1999 a 2001, no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Campinas, SP. Neste período fui Jovem Pesquisador FAPESP. Em março de 2001 ingressei na Faculdade de Informática (FACIN) da Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul (PUCRS) como Pesquisador Visitante FAPERGS. Desde junho de 2002 sou professor adjunto em regime DE da PUCRS, para onde trouxe o Laboratório de Bioinformática, Modelagem e Simulação de Biossistemas (LABIO), uma referência regional, nacional e internacional nas áreas de bioinformática estrutural e biofísica molecular computacional. No CNPq lidero o Grupo de Biofísica Molecular Computacional (GBMC). O foco das pesquisas no LABIO e do GBMC é a relação entre sequência, estrutura, dinâmica e função de macromoléculas biológicas, como proteínas, ácidos nucleicos e seus complexos. Neste sentido, desenvolvemos e aplicamos metodologias computacionais para investigar essas relações. Atuamos, mas não de forma limitada, nos seguintes temas: estrutura e dinâmica de ácidos nucleicos, estrutura e dinâmica de proteínas, predição da estrutura tridimensional (3D) de proteínas, interações proteínas (receptores)-ligantes, simulação por docagem molecular, simulação pela dinâmica molecular, modelagem comparativa por homologia, planejamento de candidatos a fármacos assistido por computador e docagem molecular de receptores totalmente flexíveis (FFR Model)-ligantes. Fui membro e apoiei as atividades dos PPG em Gerontologia Biomédica do IGG da PUCRS e do PPG em Educação em Ciências e Matemática (EDUCEM). Sou membro do núcleo permanente dos PPGs em Ciência da Computação (PPGCC), Biologia Celular e Molecular (PPGBCM) e Mestrado Profissional em Biotecnologia Farmacêutica (PPGMPBF) da FACIN, FaBio e FFARM, respectivamente. Fui membro eleito da diretoria da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional AB3C (2007-2008) e da Comissão Especial de Biologia Computacional (CEBioComp) da Sociedade Brasileira de Computação (SBC). Fui eleito, em 12 de agosto de 2011, coordenador da CEBioComp da SBC para o período 2011-2012. Sou consultor ad hoc do CNPq, CAPES, FAPERGS, FAPESP, FACEPE, FUNDECT, FIOCRUZ, LNCC, FUNDAÇÃO ARAUCÁRIA, Review Editor (Structural Biology) do Frontiers in Molecular Biosciences e ex-editor associado do ISRN Bioinformatics and BMC Genomics, além de revisor para muitos periódicos e conferências, nacionais e internacionais. Coordenei e participei da tradução do principal livro acadêmico de bioinformática disponível em língua portuguesa. Formei e contribuí para a formação de mais de 20 mestres, dezenas de doutores e de alunos de iniciação científica, graduação e especialização, originários de áreas diversas, como ciência e engenharia da computação, sistemas de informação, física, química, biologia, medicina, odontologia, biomedicina, farmácia e educação. Publiquei mais de 50 artigos científicos nos principais periódicos e conferências das minhas áreas de atuação, editei um livro em inglês e organizei conferências. Possuo várias produções tecnológicas e duas patentes. Para contato, escreva-me um e-mail: labio.osmarnds@gmail.com. Obrigado pelo interesse.
