Atua como bioinformata em evolução viral e cientista de dados. Possui doutorado em Medicina, com especialização em Virologia pela University of Kwazulu-Natal, doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), mestrado em Ciências pela Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz) e bacharelado em Sistemas de Informação pela Universidade do Estado da Bahia (UNEB). Tem experiência em desenvolvimento de sistemas de bioinformática para montagem e classificação genômica de vírus. Atualmente tem atuado na vigilância genômica de Zika, Dengue, Chikungunya, HIV, Vírus da Febre Amarela, Vírus do Nilo Ocidental SARS-CoV-2 e Vírus da Febre do Vale do Rift. Suas principais habilidades são Desenvolvimento de Software de Bioinformática, Bancos de Dados, BigData, Desenvolvimento de Pipelines, Gerenciamento e Análise de Dados de Sequência de Próxima Geração, Epidemiologia Genômica, Filogenética, Filogeografia, Clusters de Transmissão, Análise de Recombinação e Computação em Nuvem e Alta Performance para Projetos Intensivos de Dados. Além disso atua no mercado de TIC desde 2004 com: Análise e Desenvolvimento de Sistemas, Gestão de Projetos e Projetos de Infraestrutura. Possui experiências em projetos de grande porte e alta complexidade. Estes conhecimentos, abrangem as seguintes áreas de atuação: Análise e Desenvolvimento de sistemas (Web/Desktop/Mobile), Análise e Desenvolvimento para Bancos de Dados (Administração, Modelagem, Migração de dados, Tunning SQL, Otimização, Criação de Rotinas, Funções, Triggers e Stored Procedures), Coordenação de equipes de Desenvolvimento, Análise Funcional (APF, Caderno de Requisitos, Relatório de Análise e Especificação Técnica, RUP & UML), Auditoria de Sistemas, Qualidade de Software, Métodos Ágeis, Configuração e Manutenção de Servidores Windows/Linux, Servidores de Gerenciamento de Configuração e Integração Contínua.
Dr Vagner Fonseca is a bioinformatician in viral evolution and a data scientist. He has a PhD in medicine, majoring in Virology at the UKZN and a PhD in Bioinformatics at the UFMG. He has developed abilities to work with teams and setting up very advanced bioinformatics systems in the laboratory and in the field. He has been working with the genomic surveillance of Zika, Dengue, Chikungunya, HIV, Yellow Fever Virus, West Nile Virus SARS-CoV-2 and Rift Valley Fever Viruses. Dr Fonseca isn't afraid of going into the field to set up mobile genomic laboratories to respond to the epidemics as they are ongoing. His primary skills are Bioinformatics Software Development, Databases, BigData, Pipelines Development, Next Generation Sequence data Management and Analysis, Genomic Epidemiology, Phylogenetics, Phylogeography, Transmission Clusters, Recombination analysis and High Performance and Cloud Computing for Data Intensive Projects. Besides that, Dr Fonseca has been active in Information Technology sector since 2004 with: Systems Analysis and Development, Project Management and IT Infrastructure Projects. I am experienced in large projects and high complexity, covering the following areas of activity: Analysis and systems development (Web/Desktop/Mobile), Analysis and Development for Databases (Administration, Modeling, Data Migration, Tuning SQL, Optimization, Functions, Triggers and Stored Procedures), Development team manager, identification of functional prerequisites (APF, RUP, UML), Systems Auditing, Software Quality, Agile Methods, Configuration and Windows/Linux Servers Maintenance, Configuration Management and Continuous Integration Servers.
