Fábio Rogério de Moraes

Bachelor in Physics from the State University of Campinas (UNICAMP). PhD from the Genetics and Molecular Biology Departament of the Institute of Biology, also from UNICAMP. I have working experience in Biophysics, Molecular Biology, Structural Computational Biology and Bioinformatics. In my PhD, I studied the physico-chemical and structural basis of protein-protein association by using tools from relational databases (MySQL), statistical and machine learning algorithms (neural networks, SVM, random Forest, Bayesian Networks, LDA, etc), including case studies by protein-protein Docking and protein Molecular Dynamics. In the current postion, as a research assistant in the Physics Departament and Multiuser Center for Biomolecular Innovation from the Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE) da UNESP, I am responsible of the maintenance and operation of a Nuclear Magnetic Resonance spectrometer of 600 MHz, equipped with a triple resonance cryoprobe. I participate in studies of protein-ligand interaction by means of Saturation Transfer Difference effect using NMR (STD-NMR). By using the protein structure and the binding epitopes from STD-NMR, protein-ligand docking and molecular dynamics are carried out in order to get insight in the molecular recognition process. Also, in another research line, NMR-based metabolomics/metabonomics studies are carried out in order to have a more clear picture of the metabolic response of cells under different stimulus. By using statistical and machine learning tools, coupled with metabolic network analysis, it is possible to suggest important pathways affected by mutations, infection or specific treatments.

Possui Bacharelado em Física pela Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Doutorado Direto no programa de pós-graduação em Genética e Biologia Molecular pelo Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas. Tem experiência na área de Física, Biofísica; Biologia Molecular e Biologia Computacional Estrutural e Bioinformática. Em seu doutorado estudou as características físico-química e estruturais que caracterizam a formação de complexos proteína-proteína, utilizando banco de dados relacional (MySQL), algoritmos de análise estatistica e machine learning (redes neurais, SVM, random Forest, Bayesian Network, LDA, etc.), com estudo de casos que incluem análise por Docking e Dinâmica Molecular de proteínas. Atualmente é assistente de pesquisa no Departamento de Física e no Centro Multiusuário de Inovação Biomolecular do Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE) da UNESP, sendo responsável pela manutenção e operação de um equipamento de Ressonância Magnética Nuclear de 600 MHz, equipado com uma criosonda de tripla ressonância. Nessa nova posição, participa de estudos de interação proteína-ligante utilizando o efeito de STD-NMR. Baseado em estruturas proteicas e informações dos epítopos de ligação que os espectros de STD-NMR fornecem, modelagem e dinâmica molecular são utilizados para identificar modos de interação que visam aperfeiçoar o conhecimento do reconhecimento molecular. Em outra linha de pesquisa, estudos de metabolômica/metabonônica por RMN são conduzidos para identificar vias metabolólicas que são afetadas por estímulos. Técnicas de análise estatística e machine learning são utilizadas, em conjunto com análise de redes metabólicas, para sugerir vias de regulação importantes afetadas por mutações, infecções ou tratamentos específicos.