Gustavo Fonseca dedica-se a pesquisa na área de ecologia para melhor entender os mecanismos que estruturam as comunidades marinhas, na área de estatística implementando novas abordagens para lidar com dados multivariados e na área de taxonomia e sistemática para compreender a alta diversidade e o sucesso evolutivo dos nemátodas de vida-livre. Atualmente é docente no Instituto do Mar da Universidade Federal de São Paulo (Imar-UNIFESP) e está vinculado aos programas de pós-graduação Sistemas Costeiros Oceânicos (PGSISCO-UFPR), Biodiversidade e Ecologia Marinha e Costeira (PPGBEMC-UNIFESP) e Interdisciplinar em Ciências do Mar (PPGICTMar-UNIFESP).
Gustavo Fonseca is dedicated to research in the field of ecology to better understand the mechanisms that structure marine communities, in the field of statistics, implementing new approaches to deal with multivariate data and in the area of taxonomy and systematics to understand the high diversity and evolutionary success of free-living nematodes. He is currently a professor at the Instituto do Mar of the Federal University of São Paulo (Imar-UNIFESP) and is linked to the post-graduate programs Ocean Coastal Systems (PGSISCO-UFPR), Biodiversity and Marine and Coastal Ecology (PPGBEMC-UNIFESP) and Interdisciplinary in Marine Sciences (PPGICTMar-UNIFESP).