Rinaldo Wander Montalvão

BSc in Theoretical and Experimental Physics from Universidade de São Paulo (1998), MSc in Atomic Physics from Universidade de São Paulo (2001) and a PhD in Biophysics from University of Cambridge (2005). Has experience in Theoretical Physics and in particular Nuclear Magnetic Ressonance, acting on the following subjects: mathematical modelling, bioinformatics and rational drug design .

Possuo graduação em Física pelo IFSC/USP (1998), mestrado em Física das Colisões Quântica Ultra-frias (2001) e PhD em Biofísica Molecular Computacional - University of Cambridge (2005) - supervisionado por Sir Tom Blundell.Durante o PhD desenvolvi o programa CHORAL e ORCHESTRAR para modelagem de proteínas por homologia, o qual foi licenciado para comercialização como parte do sistema SYBYL-X da CERTARA, utilizado extensivamente por empresas farmacêuticas e instituições acadêmicas em todo o mundo. Este licenciamento tornou-se o ÚNICO caso na história de recolhimento de royalties ao CNPq por produto desenvolvido por estudante no exterior.Entre 2005 e 2011 trabalhei nos Departamentos de Física e de Química da Universidade de Cambridge desenvolvendo novos métodos de predição de estruturas de proteínas, usando NMR Chemical Shifts e Residual Dipolar Couplings, que hoje são amplamente aceitos pelo RCSB Protein Data Bank. Desenvolvi métodos para a solução de ensembles termodinâmicos de proteínas simples (2LJ5), complexos flexíveis (2K5X) e transmenbrânicas (2LPF). Também trabalhei com a UCB Pharma (UK) no desenvolvimento do programa Polyphony usado no desenvolvimento de novas drogas. O artigo desse programa é um dos mais acessados no BMC Bioinformatics Journal e o programa se encontra disponível para toda a comunidade científica. Também fui o co-orientador de dois alunos de doutorado nesse período.Desde de 2012 atuo como Jovem Pesquisador FAPESP no IFSC/USP onde orientado dois alunos de doutorado, um de mestrado e desenvolvo projetos na seguintes áreas:(a) Docking flexível de entre ensemble de proteínas,(b) Docking entre ensemble de proteínas e ligantes usando dados de NMR como proxy para o cálculo da contribuição entropica,(c) Banco de Dados de ligantes para virtual screening e QSAR 3D usando Harmônicos Esféricos,(d) Modelos matemáticos e computacionais para a predição de resistência às drogas causados por mutações em proteínas.(f) Modelagem de proteínas usando um sistema hibrido entre homologia, fragmentos de proteínas e dados esparsos de NMR.Tenho experiência lecionando as disciplinas de Física Matemática Aplicada à Biologia para a graduação Universidade de Cambridge (UK) e Física Matemática Computacional no IFSC/USP.