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Fábio Ribeiro Cerqueira

Dr. Cerqueira was graduated in Computer Science by Federal University of Viçosa (UFV), Brazil, in 1996. He obtained his Master Degree also in Computer Science by State University of Campinas, in 1999, accomplishing the first dissertation on DNA fragment assembly in Brazil. In 2006, he completed a postgraduate course in bioinformatics by University of Lisbon. Dr. Cerqueira obtained his PhD (European Doctorate modality) in Biomedical Informatics by University for Health Sciences, Medical Informatics and Technology, Hall in Tyrol, Austria, in 2010. From July to August of 2008, he integrated the Systems Biology Group of Institut Pasteur (Paris) as scientific visitor for developing relevant studies in proteomics. He is involved in bioinformatics projects since 1997, working formerly with advanced algorithms on DNA sequence assembly and DNA physical mapping as well as clustering techniques to microarray data analysis. Since 2006, he devotes his research to machine learning and statistical methods applied to proteomics and genomics, in addition to projects launched in 2009 involving DNA sequence assembly, immune system simulation, and clinical bioinformatics.From August of 2012 to July of 2013, he has joined the group of bioinformatics at National Laboratory of Cientific Computing for a 1-year postdoc in data mining applied to the study of bifunctional RNA in bacteria, which originated recent projects in short RNAs and short ORFs.
Possui graduação em ciência da computação pela Universidade Federal de Viçosa, 1996. Obteve seu mestrado também em ciência da computação pela UNICAMP, 1999, completando a primeira dissertação no Brasil em montagem de fragmentos de DNA. Em 2006, completou um curso de especialização em bioinformática na Universidade de Lisboa, ingressando a seguir no doutoramento. Obteve o grau de doutor (modalidade European Doctorate) em Informática Biomédica pela University for Health Sciences, Medical Informatics and Technology, Hall in Tyrol, Austria, 2010. De julho a agosto de 2008, integrou o grupo de biologia sistêmica do Instituto Pasteur, Paris, como pesquisador visitante para desenvolver estudos em proteômica. De agosto de 2012 a julho de 2013 realizou um pós-doutorado no LNCC em mineração de dados aplicada a ORFs curtas em bactérias. Está envolvido em projetos da área de bioinformática desde 1997, trabalhando, inicialmente, com algoritmos avançados para montagem de sequências de DNA e mapeamento físico de DNA, bem como técnicas de agrupamento (clustering) para análise de dados de micro-arranjos (microarrays). Desde 2006, devota sua pesquisa a métodos de mineração de dados e estatística aplicados a proteômica e genômica, além de projetos iniciados em 2009 envolvendo montagem de fragmentos de DNA, simulação do sistema imune e bioinformática clínica. Adicionalmente, está envolvido com projetos de mineração de dados na área de RNAs curtos em procariotos e eucariotos, bem como ORFs curtas em procariotos.

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