O dengue e o dengue hemorrágico são doenças febris agudas que acometem principalmente populações tropicais mas já começam a invadir regiões mais temperadas do planeta. Pesquisas têm se concentrado em vários temas pertinentes como no estudo dos mecanismos de infecção; desenvolvimento e testes de vacinas; tratamento clínico; estudos de como os vírus do dengue conseguem usar anticorpos a seu favor (aumentando a infecção) agravando a doença; desenvolvendo e entendendo os fatores genéticos que influenciam a severidade da doença; desenvolvendo diagnósticos mais rápidos, e identificando marcadores que possam predizer se um indivíduo está ou não protegido. O objetivo geral do grupo de pesquisa, Grupo de Simulação Molecular, é contribuir no entendimento, aos níveis atômico e molecular, dos processos que permitem ao vírus do dengue se fundir em células hóspedeiras e de processos que possam inibir a multiplicação do vírus, seja dificultando a sua inserção na célula, seja dificultando a construção de novas partículas virais. Estas informações são de importância fundamental para direcionar pesquisas sobre os desenvolvimentos de drogas anti-dengue. Estes procedimentos são estudados ao nível atômico a partir de informações experimentais disponíveis a respeito das estruturas protéicas 3D, das interações com receptores celulares e de processos de inibição da ação do vírus. Diversos temas principais são abordados tais como: a fusão do vírus com as células e sua inibição tanto nas fases preparatórias, quando mudanças intensas ocorrem nas proteínas virais envolvidas, como na própria fase da fusão. As seguintes técnicas são usadas: simulações por dinâmica molecular e de mecânica quântica/mecânica molecular, simulações coarse grained principalmente.
