Os pesquisadores do Departamento de Oceanografia e Limnologia trabalham com Ecossistemas Aquáticos (águas dulcícolas, estuários, mangues, e hipersalinas). Tratando diferentes níveis tróficos dos ecossistemas aquáticos (a produção primária pelas micro e macroalgas, a produção secundária de zooplâncton, além de peixes, lagostas e moluscos), inclusive dinâmica de populações, aspectos biogeoquímicos dos ecossistemas aquáticos, nutrição dos seres aquáticos e bioecologia de águas hipersalinas, macroalgas marinhas, ecomorfologia dos peixes e aqüicultura dos seres aquáticos. Ecologia Aquática e Aqüicultura são ciências de sobrevivência no sentido de sabermos como evitar o pior para animais e vegetais aquáticos, os pesquisadores do grupo optaram por estas linhas de pesquisa. A preservação e a criação de uma espécie selvagem em cativeiro depende muito do conhecimento sobre a sua biologia e ecologia. A base fornece informações técnico-científicas sobre o cultivo dos seres aquáticos.
