O NEPEMOS, com recursos da própria FURB, realiza uma investigações a respeito da evolução e tendências do Associativismo Civil do município de Blumenau - 1920/2004. Esta pesquisa envolve professores pesquisadores dos departamentos de Ciências Sociais, Serviço Social e História além de alunos bolsistas. Neste projeto o núcleo está articulado com o Núcleo de Pesquisa em Movimentos Sociais - NPMS da UFSC. O NEPEMOS participou da Rede Rizoma através de um projeto de pesquisa com a temática da educação intercultural e movimentos sociais na região sul do Brasil, em conjunto com a UFSC, projeto este apresentado ao CNPq em 1999, tendo carta consulta aprovada no mesmo ano e que teve apoio da FUNCITEC, e já concluído. Atualmente desenvolve o projeto Associativismo Civil em Blumenau nas décadas de 80 e 90 - formas de inserção na esfera pública e proposições para a ampliação e consolidação de políticas públicas, com financiamento FAPESC e que teve início em agôsto de 2004. Desenvolve tambem dois sub-projetos em torno da temática associativista financiados pelo Artigo 170 e pela própria FURB. As atividades têm subsidiado as práticas de ensino e possibilitado um maior conhecimento e atuação mais qualificada na realidade social local e regional.Em 2006 e 2007 obteve êxito em projetos ligados à FAPESC, cuja destinação da verba iniciopu em 2008.
