O NEPTA iniciou suas atividades em 2007 como grupo de pesquisa do CNPq e vinculou-se a partir de 2008 ao Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social da UFAM. O núcleo realiza estudos comparativos com base em intensiva pesquisa etnográfica focados na diversidade de formas de mobilização social de povos indígenas e tradicionais da Amazônia, bem como nos efeitos sociais de políticas territoriais em curso na Amazônia. A partir dos resultados destas investigações,o núcleo tem procurado aprofundar o campo de reflexão sobre as temáticas da política, território e cultura e apoiar movimentos sociais com instrumentos técnico-científicos que contribuam com seu protagonismo político.