O Laboratório de Microbiologia Clínica (LMC) desenvolve estudos com fungos e bactérias de interesse clínico, utilizando métodos clássicos e de Biologia Molecular em colaboração com hospitais públicos, visando vigilância epidemiológica e vigilância da resistência à fármacos e de mecanismos de virulência em patógenos, atuando ainda na avaliação de bioativos naturais com ação antimicrobiana e cicatrizante de origem variada.