Este Grupo de Pesquisa usa abordagens moleculares para abordar várias questões evolutivas. Desenvolve pesquisas em filogenética molecular aplicada à evolução de Primatas, Peixes, e Anfibios. A abordagem filogenética foi a grande contribuição para os estudos evolutivos em primatas do Novo Mundo. Nosso grupo publicou a primeira filogenia molecular envolvendo todos os táxons neotropicais (em 1993), e publicações subsequentes do grupo nesta área viraram referências internacionais. Os estudos de estrutura genética de populações em peixes, combinados com filogenética molecular, tem revelado importantes padrões de relacionamentos entre espécies e populações, com a descoberta de novas espécies e de estoques pesqueiros estruturados geneticamente. Mais recentemente, o grupo vem consolidando na UFPA as linhas relacionadas a evolução e desenvolvimento (EvoDevo), e com expressão gênica por meio de genômica e transcriptomica.