O grupo trabalha principalmente com uma abordagem evolutiva da variabilidade genômica em diferentes organismos. Essas pesquisas podem ser agrupadas em estudos ao nível populacional e em estudos de filogenia supra-específicos, utilizando uma abordagem genética e genômica.Temos principalmente projetos de ecologia molecular, filogeografia e demografia histórica, que estudam a diversidade genética e sua estruturação geográfica em populações nativas, em especial aplicada à conservação da biodiversidade. Nessa área estudamos diversos grupos de mamíferos, em especial marinhos, aves, repteis, peixes e grupos específicos de invertebrados. O grupo também atua com esta mesma abordagem em evolução de plantas nativas. O grupo também publicou diversos estudos abordando a origem e evolução das populações humanas indígenas das Américas.
