O grupo estuda aspectos de biologia molecular e genômica de protozoários do gênero Eimeria. Entre os trabalhos desenvolvidos estão ensaios diagnósticos usando diferentes marcadores moleculares. O grupo estudou ainda genomas extra-cromossômicos de Eimeria spp. incluindo genomas virais de RNA e genomas mitocondriais. O líder do grupo foi coordenador da IX International Coccidiosis Conference em 2005, encontro científico mais importante do mundo na área de coccidiose. Junto com o Laboratório Biovet S.A., desenvolveu um projeto de marcadores microssatélites que resultou em patente conjunta com a USP e FAPESP. O grupo fez ainda parte do Programa Genoma da FAPESP e do consórcio internacional do genoma Eimeria. Na área de Bioinformática o grupo tem desenvolvido diferentes programas de análise de sequências biológicas, todos livres e disponíveis para download. Entre eles está a plataforma EGene, sistema genérico de construção de pipelines para processamento e anotação automática de sequências.