Este grupo de pesquisas teve origem em 1997, tendo como agravos de interesse iniciais leishmaniose e esquistossomose e, desde inicio vinculado a um serviço ambulatorial e laboratorial que alguns anos depois foi reconhecido pelo Ministério da Saúde do Brasil como Referência Nacional em Leishmanioses Tegumentar. A missão do grupo de Pesquisa é "Realizar pesquisa, desenvolvimento tecnológico, inovação e formação de recursos humanos relacionados a diagnóstico, clínica, terapêutica e controle de doenças infecciosas e parasitárias de importância social no Brasil". Alinhada com esta missão maior, a Referência em leishamniose busca desenvolver processos e produtos para apoiar ações de controle das leishmanioses, nas três esferas de governo, por meio de atendimento ambulatorial, diagnóstico, capacitação de municípios para organização de serviços, capacitação de recursos humanos para o SUS, produção de material informativo, pesquisa, consultoria e assessoramento.
