O Grupo de Pesquisa em Áreas Marinhas Protegidas objetiva: (1) formar profissionais qualificados para o desenvolvimento de atividades de pesquisa e ensino, voltadas para o conhecimento dos processos, biológicos, ecológicos, econômicos e sociais envolvidos na implantação de Áreas Marinhas Protegidas; (2) subsidiar as agências ambientais, ONGs e grupos de interesse, através da geração do conhecimento e coleta de informações, para a criação, implantação e monitoramento de Áreas Marinhas Protegidas; (3) promover ações participativas com a população visando a capacitação e sensibilização dos grupos de interesse.