A Bioinformática Estrutural (BIE) constitui um ramo da ciência formado pela intersecção de três grandes áreas: a Bioinformática Clássica, a Biologia Molecular Estrutural e a Modelagem Molecular. Os objetivos principais da BIE envolvem a análise, simulação e predição das propriedades gerais de macromoléculas biológicas (DNA, RNA, proteínas e polissacarídeos). O Grupo de Bioinformática Estrutural (BIE) da ULBRA possui natureza interdisciplinar e multi-institucional, congregando grupos de pesquisa ligados aos departamentos de Farmácia e Química da ULBRA, bem como associações com grupos de outras instituições, como o grupo de Cristalografia de Proteínas do Laboratório Nacional de Luz de Síncrotron (LNLS), o Laboratório de Radiobiologia Molecular do Departamento de Biofísica da UFRGS e o Laboratório de Bioquímica Farmacológica do Centro de Biotecnologia da UFRGS.Algumas das aplicações mais gerais envolvendo atividades do grupo podem ser relacionadas: i) predição de estruturas tridimensionais de proteínas novas, a partir de dados estruturais de proteínas homólogas obtidas e determinadas experimentalmente; ii) estudo de mecanismos de folding, unfolding e misfolding de proteínas ; iii) estudo in silico sobre o efeito de mutações na estabilidade e na especificidade de proteínas; iv) desenho racional de fármacos, através do emprego de técnicas como 3D-QSAR e modelagem sítio-dirigida; v) análise e avaliação temporal da dinâmica conformacional e da dinâmica das interações de proteínas e seus complexos; vi) integração da análise de dados genômicos e estruturais.Em vista do que foi anteriormente mencionado, o Grupo de Bioinformática Estrutural também serve de apoio à grupos experimentais de bancada, testando e avaliando hipóteses a partir experimentos executados "in silico", ou ainda na aquisição de informações complementares cuja obtenção experimental (in vitro ou in vivo) seja impossível (ou difícil) de ser obtida.
