O grupo tem duas áreas principais de atuação: (1) desenvolvimento de aplicativos de Bioinformática para a análise de sequências e aplicação na genômica de micro-organismos e: (2) abordagens metodológicas para a descoberta de novos vírus. O grupo já desenvolveu a plataforma EGene, sistema para construção de pipelines de anotação automática de sequências, o TRAP, para catalogação e quantificação de repetições seriadas, o GenSeed, programa para a montagem progressiva de sequências de DNA dirigida por sequências semente. Mais recentemente, o grupo desenvolveu o GenSeed-HMM, que permite a reconstrução de sequências a partir de dados metagenômicos usando HMMs de perfil. O programa foi aplicado com sucesso para a descoberta de novos vírus usando como modelo fagos da subfamília Alpavirinae. O grupo ainda desenvolve e mantém o Parasite Image Database, banco relacional na web com imagens em alta resolução de parasitas com interface e descrições disponíveis em três idiomas.
