O diagnóstico microbiológico e parasitológico participa de modo destacado no suporte ao desenvolvimento de atividades envolvendo investigações epidemiológicas, tendo por referência a oferta de informações sobre a etiologia dos processos infecciosos, bem como sobre a resistência microbiana, além do apoio à atividades de investigação de surtos por agentes bacteriano e parasitários, programas educacionais, etc. As investigações epidemiológicas são empregadas na abordagem das doenças infecciosas desde a Antiguidade e estuda os determinantes da saúde, incluindo fatores sociais, biológicos e ambientais que podem influenciar na transmissão e na gravidade das doenças infecciosas. Além disso, os estudos epidemiológicos colaboram no desenvolvimento de estratégias de prevenção e controle, como vacinação, medidas de higiene, e isolamento de casos suspeitos.