Desde o início da produção comercial de petróleo, a indústria petroleira tem enfrentado problemas causados por microrganismos, os quais podem causar biodeterioração dos óleos, biocorrosão de equipamentos e tubulações, e produção de compostos indesejados, alterando características do petróleo relevantes para os processos de produção. A caracterização da microbiota presente em amostras provenientes da indústria do petróleo poderá contribuir para o melhor conhecimento dos processos biológicos responsáveis pela biodegradação do óleo; para o desenvolvimento de métodos para detectar, monitorar e controlar a biodegradação do petróleo, a acidificação de reservatórios ou mesmo a formação de biofilmes com potencial para causar deterioração de equipamentos ou processos. Além disso, permitirá inferir sobre a fisiologia dos micro-organismos e direcionar o seu isolamento seletivo para estudos detalhados de seu metabolismo e potencial exploração biotecnológica em áreas estratégias para o país.
