O Grupo de Pesquisa em Genômica Funcional do Instituto Carlos Chagas tem por objetivo a caracterização funcional de elementos moleculares biológicos (genes, RNAs, proteínas), suas modificações e interações, através do uso de técnicas em grande escala (análises ômicas) e associado a análises informatizadas de alto nível. O enfoque é em doenças de interesse da saúde pública brasileira, com ênfase em doenças infecciosas parasitárias causadas por protozoários.