Os trabalhos do grupo de Protistologia estão relacionados com estudos da Biologia e Ecologia dos protistas ciliados, flagelados, Rizópodes e opalinatas, com ênfase na taxonomia, morfologia e filogenia de ciliados. A protistologia no Brasil, principalmente relacionada aos protistas de vida livre, carece de estudos que permitam conhecimentos mais abrangentes da diversidade destes organismos presentes em ambientes aquáticos e de solos brasileiro.A linha de pesquisa geral é o estudo da biologia, ecologia e filogenia de protistas de vida livre de diferentes ambientes e de epibiontes ou endobiontes de animais invertebrados e vertebrados. E linhas de pesquisa tais como, Morfologia e Taxonomia de Protistas ciliados bioindicadores de qualidade de água de ambientes como praias, lagoas, rios e estações de tratamento de esgoto, assim como do bentos e do Plâncton marinho.
