O grupo atua na pesquisa de aspectos básicos de protozoários como a interação patógeno-hospedeiro, análise proteômica, tipagem molecular, taxonomia e filogenia e evolução do parasitismo e de organelas. O grupo atua com foco em tripanossomatídeos, tricomonadídeos e protozoários entéricos e possui publicação relevante ou projetos com fomento nesta temática. As expertises diversas reunidas neste grupo convergem para estudos que gerem dados acerca da interação patógeno-hospedeiro e prospecção e caracterização da biodiversidade, taxonomia e filogenia de protozoários isolados do ambiente e de hospedeiros. Esse grupo de pesquisa visa também contribuir para a formação de Recursos Humanos altamente qualificados e a publicação dos resultados em revistas de circulação internacional, bem como a difusão e popularização da ciência.