Os estudos do Laboratório de Limnologia englobam desde o conhecimento básico de variáveis abióticas dos corpos d'água, ocorrência, diversidade e distribuição de espécies, até experimentos específicos desenvolvidos em laboratório. Nossas pesquisas envolvem as comunidades planctônica, bentônica e de macrófitas aquáticas além dos vários aspectos de ciclagem de nutrientes entre esses compartimentos. Nessa linha, três grandes conjuntos de atividades estão sendo desenvolvidas:- Estudos Ecológicos de Lagoas Costeiras - envolvendo projetos de monitoramento ecológico das Lagoas Costeiras da Região Norte Fluminense.- Estudos de Ambientes Aquáticos da Região de Porto Trombetas (PA)- envolvendo projetos de Monitoramento Ecológico e Recuperação do Lago Batata e de igarapés.- Estudos Limnológicos na FLONA Carajás - envolvendo projetos de inventário de espécies assim como de monitoramento ecológico em lagos de altitude e reservatórios.Nossos objetivos principais são monitorar estes ecossistemas, avaliar efeitos dos diversos impactos antrópicos sobre estes e subsidiar com informações as empresas parceiras para o uso e manejo sustentável destes ecossistemas. Vários trabalhos e teses foram e estão sendo desenvolvidos englobando os seguintes aspectos: distribuição e diversidade de espécies, dinâmica populacional e ecofisiologia de fitoplâncton, zooplâncton e bentos; produção primária e secundária, densidade e diversidade bacteriana; ciclagem de nutrientes; bioturbação. Além disso,conhecimentos adquiridos por estudos científicos e conhecimentos básicos ecológicos são mediados para a comunidade através de cursos de educação ambiental para professores do ensino fundamental e médio, cursos de capacitação em ecologia para professores de biologia, cursos de gerenciamento ambiental para técnicos em meio ambiente, assessoria na área ambiental às autoridades locais e atividades de educação ambiental com escolas de primeiro e segundo grau.