Criado no primeiro semestre de 2011, junto ao PPG em Ciência da Religião da UFJF, o NEPROTES (Núcleo de Estudos em Protestantismos e Teologias) congrega pesquisadores cujos interesses se voltam ao protestantismo, ao pentecostalismo, ao ecumenismo e às relações entre religião e arte. O foco principal das pesquisas é a relação entre ideias teológicas e práticas religiosas, bem como entre ideias religiosas e práticas artísticas. Os interesses teóricos do grupo se acercam de autores como Tillich, Otto, Schleiermacher, Rubem Alves, H. R. Niebuhr e Harvey Cox. Diversas dissertações e teses foram e estão sendo gestadas no ambiente do NEPROTES, assim como inúmeros artigos acadêmicos foram já publicados. No ano de 2017, o Núcleo organizou o evento "De Lutero a Otto: o protestantismo e a ciência da religião", em cooperação com o Grupo de Pesquisa Correlativos, vinculado ao PPG em Ciências da Religião da UFS. O livro resultante do evento será publicado em 2018, pela Editora da UFS, como e-book.
