O GEMCO, Grupo de Engenharia em Compatibilidade Eletromagnética, foi criado com o objetivo de desenvolver pesquisas em Compatibilidade Eletromagnética, bem como, dar suporte na área de Engenharia Elétrica ao setor industrial e à comunidade em geral. As atividades de ensino, pesquisa e extensão contam com o suporte de equipamentos e o espaço físico destinado ao grupo no IFSC.Atualmente o GEMCO atua em uma estrutura multi-campus, e sua rede colaborativa de pesquisadores abrange os Campus de Florianópolis, Itajaí e Chapecó. Além de uma considerável produção acadêmica na área, com dissertações e teses de doutorado, seus integrantes já publicaram uma série de artigos técnicos em congressos, bem como periódicos de prestígio internacional na área de compatibilidade eletromagnética.