O NuPAF foi criado em 1991 com o propósito de desenvolver pesquisas, prestar serviços técnicos especializados e formar novos pesquisadores na área da atividade física relacionada à saúde. Desde 1993 o NuPAF está cadastrado no Diretório dos Grupos de Pesquisa do Brasil (CNPq) e tem desenvolvido projetos de pesquisa, treinamento de estagiários, cursos e eventos, com destaque para o Congresso Brasileiro de Atividade Física e Saúde (iniciado em 1997). Após 10 anos (em 2007), neste mesmo congresso, foi criada a Sociedade Brasileira de Atividade Física e Saúde, com sede em Florianópolis. O NuPAF conta com a participação de pesquisadores e estudantes nacionais e internacionais de diversas áreas acadêmicas interessados em temas que envolvam a promoção de estilos de vida saudáveis e da qualidade de vida. O Núcleo atua diretamente nos programas de Graduação e Pós-Graduação em Educação Física do Centro de Desportos, e é parceiro dos programas de pós-graduação em Saúde Coletiva e Nutrição da UFSC.
