A sobrepesca dos recursos pesqueiros é um dos problemas mais críticos e persistentes com que a comunidade ciêntífica que desenvolve pesquisas na área tem trabalhado. As medidas de gestão e conservação e ordenamento da pesca têm sido constantemente comprometidas pela sobreexplotação.Através de estudos de pesca e dinâmica populacional de peixes é possível estabelecer medidas de gerenciamento de modo a assegurar um equilíbrio entre o esforço de pesca e os recursos disponíveis no litoral maranhense. Este é objetivo deste grupo de pesquisa que tem uma abordagem interdisciplinar envolvendo as dimensões social, tecnológica, ecológica e econômica. Um outro enfoque tratado é a identificação de possíveis impactos ambientais no ambiente marinho, através de estudos de composição e estrutura das comunidades pesqueiras e determinação de indicadores biológicos.