São estudados do ponto de vista autoecológico e sinecológico os principais grupos de macroinvertebrados aquáticos continentais. É dada ênfase aos insetos e anelídeos aquáticos. Além disso, é dada atenção especial à família Chironomidae (Diptera) e aos Oligochaeta pela importância que representam nos sistemas aquáticos e pela plasticidade adaptativa que apresentam permitindo-lhes a exploração de ambientes com diferentes características tróficas. Constituem porisso, importantes em estudos da avaliação de qualidade ambiental. Outra vertente de trabalho deste grupo de pesquisa procura complementar o baixo conhecimento taxonômico e biológico através de levantamentos em diferentes regiões e da manutenção de criações em condições de laboratório. Estas poderão servir de subsídios para futuros ensaios toxicológicos.