As pesquisas na área de reprodução animal da Embrapa têm como objetivo o desenvolvimento de ferramentas biotecnológicas que permitam a preservação e a multiplicação de germoplasma de interesse para os programas de conservação e de melhoramento animal. A estratégia de ação é buscar a inovação tecnológica sem esquecer do aprimoramento constante das biotécnicas já estabelecidas. Essas atividades visam aumentar a competitividade do país na área de genético animal, abordando fatores que afetam ou limitam a produção e preservação de germoplasma e, com isso, estabelecer protocolos, manejos, tecnologias de preservação e ferramentas biotecnológicas para incrementar a atividade pecuária nacional. Um grupo de pesquisa articulado otimiza o uso de recursos humanos, financeiros e de infra-estrutura pela agregação e organização de atividades e projetos complementares, focados na resolução de problemas na área especifica do conhecimento.
