A pesquisa desenvolvida contribui com a detecção, descrição e explicação dos padrões de biodiversidade dos vertebrados, com ênfase no sudeste brasileiro. As atividades incluem a descrição de novas espécies, de caracterização de endemismos e das áreas de distribuição das espécies conforme sua ecologia e história natural, aspectos morfológicos, formulação de padrões temporais de diversificação molecular e citogenética em espécies de ampla distribuição na região neotropical. Nos últimos anos, a pesquisa incluiu aspectos relacionados à fisiologia de alguns vertebrados, como peixes e morcegos.Também são desenvolvidos estudos envolvendo aspectos da biologia básica e da história natural das espécies, relacionando-as com os padrões de distribuição e taxonomia, procurando subsidiar estudos e propostas na área da biologia da conservação.