O litoral sul do Brasil é uma das regiões de maior diversidade biológica da costa brasileira. Contudo, as crescentes alterações causadas pelo homem na região marinha e costeira têm descaracterizado e comprometido a qualidade desses ambientes, colocando em risco tanto a sobrevivência de muitas espécies, quanto a manutenção de atividades econômicas e sociais. Como consequência desta crescente ocupação e exploração, uma variedade de espécies encontra-se ameaçada de extinção, ou vem sofrendo evidente pressão antrópica. Além das espécies ameaçadas, é notório que a própria qualidade da zona costeira tem sofrido impactos decorrentes das atividades humanas, restringindo inclusive suas potencialidades de uso. Diante deste contexto, a presente proposta, a partir da cooperação de uma equipe multidisciplinar e com a utilização de diversas metodologias de estudo, visa contribuir para o monitoramento, manejo e conservação dos organismos e ambientes aquáticos da região.