A Amazônia Meridional situa-se situada entre os limites dos estados do Amazonas, Mato Grosso e Rondônia, abrangendo mais de 7 milhões de hectares, onde há 40 Unidades de Conservação federais e estaduais. A região também é conhecida mundialmente como "Arco do Desmatamento", por conta dos inúmeros problemas ambientais existentes como grilagem, garimpo, queimadas, pecuária extensiva e exploração ilegal de madeira. Para o uso sustentável desse ambiente faz-se necessário o desenvolvimento de pesquisas científicas a fim de obter informações determinantes para a garantia da conservação, manejo e produção sustentáveis do recurso florestal da Amazônia Meridional. O Grupo de Pesquisa atuará com maior intensidade nos seguintes estudos: manejo das florestas nativas, silvicultura de espécies florestais nativas; restauração de áreas degradadas; tecnologia de usos da madeira e produtos não-madeireiros de espécies florestais nativas; e caracterização ambiental p/ o manejo das Unidades de Conservação.