O laboratorio de neuroimunologia tem sua linha de pesquisa voltada para o estudo das alterações imunológicas do sistema nervoso central. Em particular, estuda-se as doenças auto-imune do sistema nervoso central como a Esclerose Multipla e seu modelo experimental, a Encefalomielite Experimental Auto-imune. A Esclerose Multipla é a mais importante doença desmielinizante que acomete o homem, normalmente adultos jovens. Assim, no laboratorio de neuroimunologia é conduzida pesquisa e acompanhamento imunológico desses pacientes. Paralelamente, desenvolve-se pesquisa no modelo experimental, no qual tem sido testado novas abordagens terapêuticas como o desenvolvimento de tolerância imunológica a neuro-antígenos e imunoterapia não especifica com a utilização de citocinas.