O grupo de pesquisa em Limnologia Aplicada desenvolve estudos associados à estrutura e funcionamento de sistemas aquáticos continentais naturais ou sob algum tipo de pressão antrópica. Por estrutura entendemos aspectos ligados à caracterização física (e.g. morfológica, hidrodinâmica), química e biológica de ecossistemas lênticos e lóticos. Por funcionamento ecossistêmico entendemos processos ligados à ciclagem de nutrientes, metabolismo ecossistêmico (produção primária, respiração), interações tróficas, fluxo de energia e transformações tróficas em nível bioquímico. Estes aspectos estruturais e funcionais são investigados em sistemas naturais e impactados por ação antrópica, como o uso da terra (atividade agropecuária, urbanização, aqüicultura) com o objetivo de se caracterizar os efeitos ecossistêmicos da exploração humana de recursos hídricos. Paralelamente objetiva-se aplicar os resultados obtidos nestes estudos em projetos de extensão e manejo voltados para a utilização sustentável de recursos hídricos.
