O Grupo de Pesquisa Educação e Religião organiza seus projetos em duas linhas, inicialmente na perspectiva da identidade pedagógica e da formação de professores do Ensino Religioso a partir da leitura escolar. Com esta intenção realizou projetos no campo da história e legislação deste componente curricular, assim como no estabelecimento dos fundamentos epistemológicos e pedagógicos do Ensino Religioso. A segunda linha de pesquisa é no campo da interferência da religião e da educação em suas diferentes frentes de ação. O GPER já orientou cursos de extensão e especialização com instituições de ensino parceiras, nas modalidades presenciais e a distância. Também já organizou duas coleções de livros para explicitar os resultados de suas pesquisas, além de outras isoladamente. Realiza pesquisa e intercâmbio para estabelecer estudos de compreensão dos modelos deste componente curricular em regiões diferenciadas. Finalmente colabora com assessoria e formação com Secretarias Municipais e Estadu