Este grupo, denominado inicialmente "Ecologia Evolutiva", foi criado em 1999, a partir da integração dos seus pesquisadores no sentido de elaborar e desenvolver projetos em conjunto, que respondessem à perguntas ecológicas e levassem ao entendimento da estruturação e funcionamento de populações e comunidades em ecossistemas maranhenses. Nesta perspectiva, desenvolvemos importantes projetos, em conjunto com outros grupos de pesquisa, apoiados pelo Programa Norte de Pesquisa e Pós-Graduação, pelo PROBIO, entre outros. O grupo apoia o Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Conservação, recomendado pela CAPES, com a primeira turma de Mestrado iniciada em 2005. O trabalho do grupo contribui decisivamente para tomadas de decisão na área ambiental no âmbito regional, uma vez que fornece dados básicos sobre as populações e comunidades do presente e do passado (Cretaceo) nos ecossistemas maranhenses.