A Universidade Estadual de Santa Cruz está localizada no município de Ilhéus, componente da bacia hidrográfica do rio Cachoeira e inserido numa das áreas mais representativas da Mata Atlântica do Sul da Bahia. Essa região apresenta uma das maiores diversidades de espécies arbóreas do mundo, sendo que sua história está intimamente ligada à cultura do cacau, que se estabeleceu a mais de cem anos em função das condições edafoclimáticas favoráveis. Face a expansão urbana e a falta de critérios técnicos na busca de alternativas econômicas à cultura do cacau, grande parte dos remanescentes florestais da região, incluindo a mata ciliar da bacia hidrográfica do rio Cachoeira vem sendo desmatados. Além disso, parte da bacia hidrográfica encontra-se poluída por metais. Por outro lado, apesar da grande diversidade de plantas nativas no sul da Bahia muito pouco se conhece a respeito dos aspectos ecofisiológicos associados com a distribuição dessas espécies nos diferentes habitats; informações necessárias para o seu manejo em ambientes antropizados. A exploração de diversas espécies com potencial econômico é feita de forma indiscriminada, necessitando o aprofundamento dos estudos para definir melhores formas de manejo e aproveitamento do seu potencial produtivo. Assim, o grupo de pesquisas tem como objetivo auxiliar o desenvolvimento de ações teóricas e práticas que viabilizem o manejo de espécies nativas e cultivadas e a recomposição de trechos de ecossistemas degradados da Mata Atlântica do Sul da Bahia. Tem-se buscado atender a uma demanda crescente por informações acerca de espécies apropriadas para a recuperação de áreas degradadas, para o manejo de sistemas agroflorestais, para o bioindicação e bioacumulação de poluentes e para a viabilização de matérias primas voltadas para a produção de combustíveis líquidos.
