O NEPST foi estruturado como Grupo de Pesquisa (GP) em 2001 como forma de organização de pesquisas que vinham em andamento desde 1994. A Saúde do Trabalhador é o principal objeto de atenção do GP, que conta com projetos envolvendo a promoção da saúde e integralidade, a atenção ao riscos ergonômicos e seus desdobramentos em atividades de trabalho, bem como, a reabilitação de trabalhadores. Um forte projeto do NEPST é o Núcleo de Promoção e Atenção Clínica à Saúde do Trabalhador - NUPAC-ST, que envolve um Termo de Cooperação Técnico Científica entre o Ministério Público do Trabalho-MPT de Santa Catarina e o NEPST. Este Núcleo desenvolve trabalhos de promoção e atenção clínica integrada à trabalhadores com Distúrbios Osteomusculares Relacionados ao Trabalho-DORT e conta com 7 áreas (Fisioterapia, Medicina, Psicologia, Enfermagem, Nutrição, Farmácia e Assistência Social). O NEPST tem relações com o Programa de Pós-Graduação em Saúde Coletiva - PPGSCol / UNESC (Mestrado Profissional).
