A constituição do CEPESCO visa provocar e estimular o aperfeiçoamento do processo de qualificação da força de trabalho em saúde, com vistas a instrumentalizá-la para o fortalecimento do SUS. Tem a responsabilidade com a investigação, o ensino, a extensão e a assistência, no sentido de propiciar o desenvolvimento das potencialidades dos sujeitos envolvidos, e para tanto, é indispensável identificar oportunidades, exercitar a criatividade, produzir fatos e relações sociais que contribuam para o exercício da cidadania Tem como missão sistematizar reflexões sobre as questões de saúde, realizar ações de desenvolvimento de recursos humanos, no ensino, na pesquisa, bem como oferecer assessoria e consultoria técnica às instituições de saúde, ao Estado de Rondônia e outros Estados da Amazônia, nos projetos específicos de saúde coletiva, visando contribuir para a consolidação do Sistema Único de Saúde - SUS. Além disto, se propõe a manter uma integração permanente com os serviços de saúde realizando investigações sobre as diversas áreas que integram a saúde coletiva, na perspectiva de propiciar mudanças nas práticas sanitárias, no processo saúde-doença,nas políticas de saúde e na organização dos serviços de saúde.