O grupo Pesquisa em Micologia atua interdisciplinar, interdepartamental e interinstitucional, com parcerias com várias Instituições Públicas e Privadas. Desenvolvendo trabalhos de monitoramento de doenças causadas por fungos filamentosos e leveduras, estudo da sensibilidade a antifúngicos, em especial Malassezia pachydermatis, patologia, epidemiologia, fatores de patogenicidade e biologia molecular do Complexo Sporothrix. Em grandes animais estuda-se a epidemiologia e o impacto econômico e/ou de importância em saúde pública de tricofitíases em animais domésticos e silvestres. Realizando também estudos pioneiros em oomicetos com o monitoramento e controle da pitiose na região Sul. Projetos em micotoxicoses voltam-se para aflatoxicoses e fusariotoxicoses de importância sócio-econômicos na produção e com resultados expressivos na leucoencefalomalácia equina .A prospecção e avaliação de antimicrobianos naturais são áreas em desenvolvimento buscando extratos vegetais com ação antifúngica.
