O grupo Agroecologia e Agrobiodiversidade tem por objetivo desenvolver ações de pesquisa multidisciplinares e multiinstitucionais, em busca de insumos biológicos para o controle de fitopatógenos, de ervas daninhas e para a promoção de crescimento vegetal, visando atender as demandas da produção orgânica e contribuir para o desenvolvimento sustentável da agricultura, em especial das unidades agrícolas familiares, nos seus aspectos ambientais, sociais e econômicos. Essa repercussão dar-se-á na medida em que as informações resultantes das pesquisas possam, ser empregadas para subsidiar a geração de novos produtos para controle biológico de fitopatógenos, bioherbicidas e insumos para promoção de crescimento vegetal, assim como novas normativas e/ou políticas públicas relacionadas a sistemas de produção orgânica ou de base agroecológica.