O Grupo de Anatomia Patológica realiza projetos de pesquisa sobretudo nas áreas de Medicina e Odontologia. Apresenta como linha de pesquisa principal o "Diagnóstico clínico, epidemiológico e laboratorial das Patologias", por meio de projetos relacionados ao estudo das alterações morfofuncionais em intoxicações (peçonhas de serpentes, abelhas africanizadas e raias), doenças infecciosas e tropicais de repercussão médica (hepatites virais, tuberculose e HPV). Na área odontológica, os projetos envolvem Patologias Bucais, com ênfase em carcinomas epidermóides (lábio e intra-orais), manifestações orais de doenças onco-hematológicas, avaliação histológica de glândulas salivares menores de pacientes portadores de Síndrome de Sjogren, além de projetos envolvendo lesões infecciosas, manifestações orais da AIDS e patologias da ATM. Também são desenvolvidas pesquisas para análise morfológica-toxicológica aguda e crônica de extratos vegetais. O integrantes do grupo estão vinculados aos seguintes P