A química de produtos naturais é considerada como a parte da química que se dedica ao isolamento e identificação de metabólitos secundários de plantas, também conhecidos como produtos naturais. Enquanto o metabolismo primário é comum a todos os seres vivos e envolve a produção de substâncias vitais, o metabolismo secundário envolve a produção de substâncias anteriormente consideradas secundárias. Sabe-se no entanto, atualmente que essas substâncias são extremamente importante para as plantas que as produzem, sendo as responsáveis por diversos mecanismos de adaptação. Além do isolamento e identificação destes metabólitos secundários, a química de produtos naturais também abrange a distribuição dessas substâncias no reino vegetal (quimiossistemática) e o seu papel nas relações entre a planta e o seu meio-ambiente (ecologia química). Dentre as diferentes linhas de pesquisa na área de produtos naturais, salientamos a relevancia de duas delas: ecologia química e estudo da variabilidade quím
