As pesquisas do grupo se encontram centralizadas tanto no desenvolvimento e integração de ferramentas de Bioinformática para análises de genomas e transcriptomas, bem como em análises de evolução molecular de genes de tripanosomatídeos. O grupo participa no projeto do sequenciamento e análise dos genomas do Trypanosoma vivax e Trypanosoma congolense, bem como no projeto que visa desenvolver uma plataforma integrada para análises comparativas de genomas e transcriptomas. As iniciativas de Bioinformática visam o desenvolvimento de ferramentas que sejam amigáveis, disponíveis para uso público na web, e ajudem na obtenção de informação biológica a partir dos genomas sequenciados. Mais recentemente o grupo tem começado a trabalhar com "biologia de sistemas" (systems biology), tendo como objetivo o desenvolvimento de uma plataforma (multi-usuário) de análises de genomas que consiga extrair o máximo de informação funcional, combinando dados genômicos, expressão gênica, estruturas 3D e evolução. O ProtozoaDB (http://protozoadb.biowebdb.org) e STINGRAY (http://stingray.biowebdb.org) são alguns dos sistemas desenvolvidos pelo grupo.
