A linha de pesquisa mais antiga do grupo é a fixação biológica do nitrogênio, envolvendo diversidade de rizóbios associados a amendoim, feijão, grão de bico e adubos verdes, visando conhecer a eficiência dessas simbioses para determinar a necessidade de inoculação. Iniciou as pesquisas com micorrizas arbusculares no Brasil, e os principais enfoques dessa área são as culturas que passam por fase de produção de mudas, como café, fruteiras, cana de açúcar e plantas ornamentais, e a fitorremediação de áreas degradadas por excesso de metais pesados. Os estudos com as bactérias promotoras do crescimento de plantas (BPCP), rizosféricas e endofíticas, têm revelado isolados eficientes e permitido a análise da comunidade bacteriana associada à planta, por meio de técnicas moleculares, determinando-se a diversidade genética e funcional. Ainda realiza pesquisa com indicadores microbiológicos da qualidade do solo, como ferramenta de avaliação de sistemas de manejo de culturas agrícolas.
