O grupo Manejo de Doenças de Plantas promove o treinamento de discentes de graduação, mestrado e doutorado e pesquisadores e professores universitários brasileiros e estrangeiros. As pesquisas visam ao controle químico, cultural e biológico de nematóides, bactérias e fungos; à indução de resistência, uso de silício, extratos e óleos vegetais, nutrição mineral e manejo da irrigação no controle de doenças de plantas; detecção, identificação, caracterização molecular e biológica de bactérias, nematóides, fungos e vírus em materiais propagativos. As pesquisas têm gerado publicações em revistas científicas e técnicas e apresentações em Congressos e Simpósios internacionais, nacionais e regionais. De 10 a 14/08/08 o grupo organizou o XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Em parceria com o Núcleo de Estudos em Fitopatologia (NEFIT) o grupo organiza anualmente o Simpósio de Manejo de Doenças de plantas cujo tema em 2016, XVI edição, foi "Integrando Técnicas para Entregar Resultados".