Este Grupo de Pesquisa objetiva estudar de forma integrada, utilizando o estuário da Lagoa dos Patos e as regiões oceanica costeira e limnica adjacentes como pontos de comparação, a ecologia e sistemática das espécies de peixes que ocorrem nas lagoas costeiras e estuários do Rio Grande do Sul. Visa também, fornecer subsídios para a correta administração ambiental na região. Neste contexto são desenvolvidas atualmente 4 linhas de pesquisas: a) Bio-Ecologia de peixes. b) Morfometria e Ecomorfologia. c) Estudos de Longa duração e sua relação com o fenômeno "El Niño"., d) Ecologia e Pesca.